【摘要】：目的建立柯萨奇A组6型病毒TaqMan探针实时荧光RT-PCR,用于手足口病例快速诊断及监测。方法根据GenBank中柯萨奇A组6型病毒VP1高保守序列设计引物和探针,建立和优化实时荧光RT-PCR反应体系,评估其特异性、灵敏度、稳定性,在手足口病监测中应用,并与商品化试剂比较,抽取部分阳性标本测序验证。结果本研究建立的柯萨奇A组6型病毒实时荧光RT-PCR可在60 min内完成检测,与其它型别的肠道病毒和病原体无交叉反应,灵敏度可达10~0 copies/μL梯度,对两个不同核酸浓度样本Ct值的变异系数分别为0.29%、0.38%。280份非EV71、CA16的标本中检出142份CA6阳性标本,与商品化试剂检测结果一致。随机抽取15份阳性标本产物测序,与CA6靶基因序列同源性99.8%以上。结论建立的柯萨奇A组6型病毒实时荧光RT-PCR方法特异、灵敏、稳定,可用于非EV71、非CA16的其它肠道病毒标本分型。

【关键词】： 手足口病 柯萨奇A组型病毒 实时荧光RT-PCR
【分类号】：R440;R512.5
【正文快照】：
手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)是我国丙类法定报告传染病,临床表现以发热和手、足、口腔和臀部等部位出现皮疹,主要病原体为柯萨奇病毒(coxsackie virus)A组的2、4、5、6、8、9、10、16型,柯萨奇病毒B组的1、2、3、4、5型,部分埃可病毒(ECHO-viruses)和肠道病毒
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